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新一轮国务院机构改革方案显示，中国将改革国税地税征管体制，省级和省级以下国税地税机构合并，具体承担所辖区域内各项税收、非税收入征管等职责。国税地税机构合并后，实行以国家税务总局为主与省（区、市）人民政府双重领导管理体制。由于地税在中央没有部委这一层，这项方案实际上就是国地税合并。
1994年中国实行分税制后，地税负责地方税种的征收，国税负责中央税和共享税的征收，防止税收收入混库。但是，随着经济的发展，两个征税机构的运行效率与运行成本问题开始突出。
首先，两套机构会增加纳税人的负担和成本，这里的纳税人包含两个意义，一是企业纳税人要同时缴国税、地税，使得纳税人纳税成本增加，合并后，在纳税人申报及应对税务机关检查方面会减少了企业的税收合规成本。另外，本来一套机构就可以完成的任务，要由两套机构完成，存在资源重置，势必会导致财政成本大增，从而增加全体纳税人的负担。
其次，就是税收会成为干扰企业与市场的一个制度因子。除了国税地税各种检查之外，地方政府拥有税收裁量权后，经常以税收优惠吸引投资，如果一个地方给出企业巨大的税收优惠，那么，对其他地方的同类竞争企业而言，是不公平的。而且，经常发生地方之间为了抢夺企业投资，而进行税收优惠比赛，很多时候由纳税人买单。
当初实行分税制的主要原因是防止国税与地税混库。现在，中国大规模提升了信息化程度，尤其是各种实名制、编码、联网等，建立了名为金税工程的高科技管理系统，中央和地方通过分开收税的方法分享税收收入已变得不必要，完全可以通过电子信息化系统的处理完成这一工作，技术的进步为征税改革提供了条件。
行政部门的机构改革，主要目的是为了适应新时代发展要求，推动国家治理能力与治理体系的现代化，重点放在转职能，转方式，转作风，优化政府机构职能配置，提高政府运行效率效能，为实现高质量发展提供支撑。根据这些原则，中国机构改革的一个主要特征就是，通过合并相关职能部门以明晰权责，提高效率，减少职能交叉与资源重置。
中国改革的一个主要目标是让市场在资源配置中起决定性作用、更好发挥政府作用。这需要大幅减少行政部门对市场的不合理的干预，简政放权。但是，如果不对相关机构进行职能调整与裁员，那么，就很难实现简政放权，毕竟这些机构和人员组成的“有形之手”需要有事可做。因此，优化政府机构职能配置，提高政府运行效率效能，让市场在资源配置中起决定性作用，更好发挥政府的作用，就必须推进机构改革。国税与地税合并就是在这一指导思想下的产物。
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